Protein–RNA interactions for Protein: O95025

SEMA3D, Semaphorin-3D, humanhuman

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Length 777 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3DO95025 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SEMA3DO95025 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SEMA3DO95025 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SEMA3DO95025 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SEMA3DO95025 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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