Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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MTSS1O43312 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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MTSS1O43312 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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MTSS1O43312 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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MTSS1O43312 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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MTSS1O43312 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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MTSS1O43312 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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MTSS1O43312 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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MTSS1O43312 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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MTSS1O43312 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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