Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms