Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms