Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms