Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms