Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWF9

TRBV2, T-cell receptor beta variable 2 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV2A0A0J9YWF9 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRBV2A0A0J9YWF9 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV2A0A0J9YWF9 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV2A0A0J9YWF9 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV2A0A0J9YWF9 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV2A0A0J9YWF9 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV2A0A0J9YWF9 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV2A0A0J9YWF9 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV2A0A0J9YWF9 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV2A0A0J9YWF9 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV2A0A0J9YWF9 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV2A0A0J9YWF9 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV2A0A0J9YWF9 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV2A0A0J9YWF9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV2A0A0J9YWF9 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV2A0A0J9YWF9 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV2A0A0J9YWF9 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV2A0A0J9YWF9 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV2A0A0J9YWF9 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV2A0A0J9YWF9 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV2A0A0J9YWF9 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV2A0A0J9YWF9 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV2A0A0J9YWF9 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV2A0A0J9YWF9 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV2A0A0J9YWF9 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV2A0A0J9YWF9 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV2A0A0J9YWF9 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV2A0A0J9YWF9 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV2A0A0J9YWF9 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV2A0A0J9YWF9 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV2A0A0J9YWF9 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV2A0A0J9YWF9 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV2A0A0J9YWF9 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV2A0A0J9YWF9 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV2A0A0J9YWF9 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV2A0A0J9YWF9 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV2A0A0J9YWF9 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV2A0A0J9YWF9 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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