Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms