Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

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Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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HDGFL3Q9Y3E1 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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HDGFL3Q9Y3E1 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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HDGFL3Q9Y3E1 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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HDGFL3Q9Y3E1 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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HDGFL3Q9Y3E1 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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HDGFL3Q9Y3E1 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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HDGFL3Q9Y3E1 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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HDGFL3Q9Y3E1 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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HDGFL3Q9Y3E1 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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HDGFL3Q9Y3E1 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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HDGFL3Q9Y3E1 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HDGFL3Q9Y3E1 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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