Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP8A1Q9Y2Q0 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms