Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms