Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A4Q9UP95 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms