Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms