Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms