Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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RAB23Q9ULC3 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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RAB23Q9ULC3 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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RAB23Q9ULC3 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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RAB23Q9ULC3 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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RAB23Q9ULC3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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RAB23Q9ULC3 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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