Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms