Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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TRPC4Q9UBN4 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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TRPC4Q9UBN4 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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TRPC4Q9UBN4 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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TRPC4Q9UBN4 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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TRPC4Q9UBN4 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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TRPC4Q9UBN4 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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TRPC4Q9UBN4 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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