Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PFDN4Q9NQP4 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PFDN4Q9NQP4 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PFDN4Q9NQP4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PFDN4Q9NQP4 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PFDN4Q9NQP4 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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