Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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TRIM8Q9BZR9 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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TRIM8Q9BZR9 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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TRIM8Q9BZR9 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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TRIM8Q9BZR9 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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TRIM8Q9BZR9 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM8Q9BZR9 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM8Q9BZR9 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM8Q9BZR9 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TRIM8Q9BZR9 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TRIM8Q9BZR9 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TRIM8Q9BZR9 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM8Q9BZR9 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM8Q9BZR9 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM8Q9BZR9 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM8Q9BZR9 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM8Q9BZR9 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM8Q9BZR9 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM8Q9BZR9 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM8Q9BZR9 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM8Q9BZR9 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM8Q9BZR9 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM8Q9BZR9 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM8Q9BZR9 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM8Q9BZR9 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM8Q9BZR9 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM8Q9BZR9 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM8Q9BZR9 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM8Q9BZR9 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM8Q9BZR9 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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