Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCAPERQ9BY12 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms