Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 NQO2-205ENST00000380455 10084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC92-208ENST00000545135 4883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 AKAP13-202ENST00000394510 9128 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 DGCR5-203ENST00000438934 5492 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF740-201ENST00000416904 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms