Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms