Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
KATNB1Q9BVA0 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KATNB1Q9BVA0 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms