Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms