Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMM29Q9BSF4 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms