Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms