Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST8

CEP89, Centrosomal protein of 89 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP89Q96ST8 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP89Q96ST8 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms