Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC114Q96M63 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms