Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
EP400Q96L91 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EP400Q96L91 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EP400Q96L91 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
EP400Q96L91 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
EP400Q96L91 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
EP400Q96L91 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
EP400Q96L91 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms