Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 PPP1R12A-203ENST00000450142 5721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 CDH1-214ENST00000621016 3304 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 PPP4R3B-206ENST00000616407 4385 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 EFCAB11-208ENST00000555872 2716 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 AP1B1-205ENST00000415447 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 ZNF436-202ENST00000374608 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 MIEF1-203ENST00000404569 3797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 CEP170-204ENST00000366544 6805 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 SUPT5H-215ENST00000599117 3902 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 AC004990.1-202ENST00000454234 1965 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 UBXN4-201ENST00000272638 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 FAM214B-201ENST00000322813 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 RGL4-210ENST00000615003 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 CES1-201ENST00000360526 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 TBC1D16-202ENST00000340848 4244 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 AGPAT1-204ENST00000395496 2103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 TRAK1-206ENST00000449246 3260 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 ANAPC7-201ENST00000450008 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 STAG3L5P-PVRIG2P-PILRB-201ENST00000310771 3634 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 POLR2M-202ENST00000380557 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 ADAMTS4-202ENST00000367996 9773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 MON2-212ENST00000552115 3760 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 CCDC120-207ENST00000606812 3857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 AP1G2-202ENST00000397120 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 PCGF2-207ENST00000620225 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 SEC14L1-212ENST00000585618 2712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 ZNF711-203ENST00000373165 4124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ANKRD18CP-201ENST00000354752 2980 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 PKD2L1-201ENST00000318222 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 LINC01134-203ENST00000442673 3059 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ANKMY1-201ENST00000272972 3228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 TIAM2-206ENST00000456877 3275 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 CLPB-203ENST00000437826 3379 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 SULF1-223ENST00000616868 3381 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 USP11-204ENST00000377107 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ATP6V1B1-201ENST00000234396 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ELN-201ENST00000252034 3781 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 AC093330.2-201ENST00000624814 3998 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 OR1I1-202ENST00000641398 5984 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 DDR1-223ENST00000324771 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 MPP2-220ENST00000622681 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ZSCAN30-202ENST00000420878 4323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 PACRG-AS1-201ENST00000626335 2192 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ZNF555-203ENST00000591539 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ERI1-201ENST00000250263 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 TACC1-211ENST00000520973 2564 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 RAB7B-202ENST00000617991 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 MMS19-203ENST00000370782 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 APBA2-204ENST00000558259 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 AL031846.2-201ENST00000624656 3671 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 PPP4R1-202ENST00000400555 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ARHGEF2-203ENST00000361247 4149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 THUMPD1-201ENST00000381337 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 RIPOR1-205ENST00000540839 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 UTY-203ENST00000362096 4990 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 MOB3C-201ENST00000271139 2800 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 SEC23B-202ENST00000336714 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 DPP4-201ENST00000360534 3904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 UGT1A7-201ENST00000373426 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 VDR-202ENST00000395324 4762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 RNF10-203ENST00000413266 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms