Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms