Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.2 ms