Protein–RNA interactions for Protein: Q96DV4

MRPL38, 39S ribosomal protein L38, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL38Q96DV4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL38Q96DV4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms