Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC11Q96DB2 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms