Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms