Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRIM41Q8WV44 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms