Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM35BQ8NCS4 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM35BQ8NCS4 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM35BQ8NCS4 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM35BQ8NCS4 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM35BQ8NCS4 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM35BQ8NCS4 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM35BQ8NCS4 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM35BQ8NCS4 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM35BQ8NCS4 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM35BQ8NCS4 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM35BQ8NCS4 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM35BQ8NCS4 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM35BQ8NCS4 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM35BQ8NCS4 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM35BQ8NCS4 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM35BQ8NCS4 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM35BQ8NCS4 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM35BQ8NCS4 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM35BQ8NCS4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM35BQ8NCS4 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM35BQ8NCS4 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM35BQ8NCS4 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms