Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms