Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 BAIAP3-204ENST00000426824 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 FGFR1-211ENST00000425967 5375 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 SNX22-201ENST00000325881 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 CEACAM20-203ENST00000614924 1809 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 CHGB-201ENST00000378961 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 RIC8A-203ENST00000526104 3703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 AQP2-201ENST00000199280 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC3A1-205ENST00000409387 2334 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 RBM4-205ENST00000409406 2321 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 MAGED1-201ENST00000326587 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 NPLOC4-202ENST00000374747 5538 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 AL132642.2-201ENST00000623423 1998 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 NLRP2-214ENST00000543010 3576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 PDP1-202ENST00000396200 4358 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 ATXN2-226ENST00000608853 4376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC47A1-201ENST00000270570 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 TAOK2-201ENST00000279394 4246 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 ERCC5-201ENST00000355739 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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COL5A1-AS1Q5SY13 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 ZIC3-201ENST00000287538 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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COL5A1-AS1Q5SY13 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 JDP2-203ENST00000435893 5401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 ACVRL1-206ENST00000550683 4121 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 AKAP8-201ENST00000269701 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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COL5A1-AS1Q5SY13 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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COL5A1-AS1Q5SY13 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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COL5A1-AS1Q5SY13 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 SOX30-201ENST00000265007 3265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 PCDH12-201ENST00000231484 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 ST3GAL6-228ENST00000613264 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM198B-207ENST00000592057 3425 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 COL11A1-210ENST00000512756 5442 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
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