Protein–RNA interactions for Protein: Q5FBB7

SGO1, Shugoshin 1, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1Q5FBB7 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SGO1Q5FBB7 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SGO1Q5FBB7 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SGO1Q5FBB7 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SGO1Q5FBB7 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SGO1Q5FBB7 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SGO1Q5FBB7 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SGO1Q5FBB7 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SGO1Q5FBB7 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SGO1Q5FBB7 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SGO1Q5FBB7 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SGO1Q5FBB7 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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