Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HSD17B12Q53GQ0 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms