Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLHL12Q53G59 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms