Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP27-1Q3LI81 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms