Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 RN7SL756P-201ENST00000488739 268 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AC139493.2-202ENST00000510155 544 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AC108082.1-201ENST00000510857 331 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 PDLIM5-217ENST00000512274 372 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 SEMA6A-AS1-206ENST00000514214 782 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AC087354.1-201ENST00000522373 1037 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AC027228.1-201ENST00000560094 325 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AP003096.1-201ENST00000565199 503 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 PSMD7-205ENST00000568615 931 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 Metazoa_SRP.51-201ENST00000570437 272 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AC116914.2-201ENST00000571741 291 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AC008686.1-201ENST00000586894 565 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 BLVRB-202ENST00000595483 649 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AC136475.7-201ENST00000602949 592 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 PRKN-210ENST00000612540 603 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AC245369.3-201ENST00000624687 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 BARD1-214ENST00000620057 1456 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 OXNAD1-206ENST00000605932 1681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 GUCY1A3-213ENST00000621234 1788 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 PPIG-208ENST00000462903 1516 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 DRICH1-201ENST00000317749 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 MEMO1-207ENST00000426310 1336 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01515-201ENST00000433152 1339 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 PDE9A-211ENST00000398232 1885 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 LILRA5-201ENST00000432233 1363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 NME1-201ENST00000013034 796 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 KRTAP20-2-201ENST00000330798 384 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 RPL15-202ENST00000354811 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 S100B-202ENST00000367071 971 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP20-1Q3LI63 C1QTNF9B-201ENST00000382137 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms