Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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COL24A1Q17RW2 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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COL24A1Q17RW2 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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COL24A1Q17RW2 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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COL24A1Q17RW2 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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COL24A1Q17RW2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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COL24A1Q17RW2 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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COL24A1Q17RW2 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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