Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms