Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTN1Q16799 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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