Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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HIST3H3Q16695 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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HIST3H3Q16695 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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HIST3H3Q16695 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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