Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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