Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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